新農村專業一體化廢水處理設備在總體設計中，應充分考慮污水處理工藝流程各個部分的特性，覆蓋污水處理的各個環節，如沉砂池——較初沉淀池——反應槽——較終沉淀池——消毒設備——污泥處理等。這一自動化控制系統應該包括中央控制室監控系統、可編程控制器(PLC)，檢測儀表，閉路監控，避雷等。一體化污水處理設備應該能夠及時全面地反映出污水處理過程的運行工況、工藝參數的變化等信息，保證適用性強，開放性好，保證出水水質，節省成本，保證提高運行管理水平。
新農村專業一體化廢水處理設備這一系統可以分為現場控制層和管理監控層兩個部分。現場控制層通過現場控制器實施控制。這是一個實時監控的體系，24小時實現監控。它實現了污水處理所有環節的過程參數和設備運行狀態監控;它還實現對電氣參數的數據采集，對單元過程、設備進行控制。它利用網絡向監控層傳送數據，按照監控層的控制指令，實現對現場設備的數據采集、報警、控制和連鎖等。管理監控層全面采用組態軟件，數據傳輸、通訊通過開放式通訊協議進行實現。在運行的過程中，將形成實時數據庫，同步完成畫面的組態設置。不僅如此，這一大監控層，還能參與生產數據報表計算和統計，通過大量的數據信息，同步降低管理的強度，使管理更加科學化、系統化和規范化，有力地促進管理水平的飛躍。
