高效液相色譜儀按其固定相的性質可分為高效凝膠色譜，疏水性高效液相色譜，反相高效液相色譜高效離子交換液相色譜，高效親和液相色譜以及高效聚焦液相色譜等類型。用不同類型的高效液相色譜分離或分析各種化合物的原理基本上與相對應的普通液相層析的原理相似。其不同之處是高效液相色譜靈敏，快速，分辨率高，重復性好，且須在色譜儀中進行。
高效液相色譜儀
分離系統的主要元件是色譜柱，它是色譜分離過程中存放固定相的場所。離子色譜儀的柱填料是離子色譜儀研究的熱點，是離子色譜儀發展的主要推動力，發展很快,離子檢測器分為兩大類，即電化學檢測器和光學檢測器，電化學檢測器包括電導、直流安培、脈沖安培和積分安培等，而光學檢測器包括紫外、可見光和熒光檢測器。
所有的離子化合物（有機離子、無機離子、強酸和強堿）以及可被解離的化合物（弱酸和弱堿）的水溶液都能夠導電。電導檢測器就是以離子色譜流動相中導電的變化作為定量的依據的。電導檢測器的結構比較簡單、檢測池在兩個電極中間，當在電極上加上電壓時，檢測池內溶液中的離子就會產生運動。通過對運動產生的電流的測量就可以知道溶液中離子的濃度。而如果流動相的導電性很高，而樣品的導電性較低，那么電導檢測器就不會有效的檢測出樣品離子的濃度。因此，人們在色譜柱和電導檢測器之間加上了一個抑制柱，它可以改變流動相和樣品的導電性，從而使樣品離子得到靈敏的檢測。
分離系統是色譜儀的心臟部分。其作用就是把樣品中的各個組分分離開來。分離系統由柱室、色譜柱、溫控部件組成。其中色譜柱是色譜儀的核心部件。色譜柱主要有兩類：填充柱和毛細管柱（開管柱）。柱材料包括金屬、玻璃、融熔石英、聚四氟等。色譜柱的分離效果除與柱長、柱徑和柱形有關外，還與所選用的固定相和柱填料的制備技術以及操作條件等許多因素有關。
