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飛行時間質譜儀（TOF）是一種非常常見的質譜儀。質譜儀的質譜儀是一種離子漂移管。離子源產生的離子被加速進入無場漂移管，以恒定速度飛向離子接收器。離子質量越大，到達接收器的時間越長，離子質量越小，到達接收器的時間越短。根據這一原理，可以根據m/z值分離不同質量的離子。
工作原理：
飛行時間質譜儀的原理是測量離子從離子源到達探測器的時間。這個過程包括在離子源中產生離子束，然后加速并測量從離子源到探測器的時間。
一個通徑管，通常長約2米。所有的離子在加速區都接收到相同的動能，但是它們的質量不同，所以它們的速度不同，通過漂移管（TOF）到達探測器的時間也不同。
所謂飛行時間質譜（tofms）是指它的質量分析是基于通道中離子的飛行時間。
提取電壓后，單價離子獲得相同的動能。由于不同離子的質量不同，飛行速度也不同，同一通道的飛行時間也不同。
有四級棒質譜法：通過改變交流電壓來選擇不同的離子。
扇形磁場質譜法：根據離子在磁場中的不同軌跡來鑒別離子。
其基本原理是將分析物分散在基體分子中，干燥后形成晶體。當晶體被激光照射時，基體分子通過輻射吸收的能量會導致能量的積累和快速的發熱，使基體晶體升華，使基體和被分析物膨脹進入氣相。MALDI產生的質譜大多是單電荷離子，因此質譜中的離子與核酸的質量相對應。離子的質量越小，它們到達的速度就越快。
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