一、火災危險源多，火災發生概率高
在醫藥、化工、電子等行業，以生產工序或生產流程的流水作業要求來劃分功能的情況比較突出，這使某些危險工序或危險設備直接影響到建筑和人員的安全。特別是一些使用原料或生產過程中產生的中間產品帶有易燃易爆危險性的，無法從建筑構造或建筑布局中加以防范，使得廠房的火災危險性大大增加。
二、潔凈區域大，防火分隔困難
隨著現代工業特別是電子工業類的飛速發展以及潔凈技術的不斷更新，潔凈區的面積也不斷增大。如某芯片生產企業根據工藝需求潔凈區面積達近十萬平方米，穿孔樓板使工廠潔凈區與原料設備區融為一體，潔凈區又與送回風井道一體化設計，高度達二十余米。對于此類超大型的潔凈廠房，水平垂直防火分區分隔的設置困難重重。當發生火災時，火災產生的煙塵易蔓延至整個廠區，造成全面性的損害。
濰坊凈化車間與無塵車間-潔凈廠房施工案例
三、室內迂回曲折，人員疏散困難
隨著潔凈區面積的不斷增大，對空氣懸浮粒子濃度控制要求的不斷提高，潔凈廠房內工藝隔離措施、除塵防塵設施也不斷增加。廠內走廊、通道的布置均要先滿足工藝的要求，使得室內平面布置迂回曲折，人員疏散困難。大部分醫藥、電子、食品類潔凈廠房屬于勞動密集型廠房，特別是包裝車間、裝配車間等，大多是車間小、人員多，發生火災也易造成群死群傷。
四、建筑結構密閉，排煙撲救困難
為保證潔凈室的凈化度要求和節約能耗，生產區往往不設外窗或設數量較少的固定窗，生產空間保持結構密閉，一旦發生火災，熱量難以散發，煙氣難以排出，使得人員疏散和滅火救援火場排煙越發困難。部分潔凈廠房的保溫材料在火災時釋放出的有體被引入封閉的潔凈廠房，也給人員疏散和火災撲救帶來*的困難。此外，潔凈室的分隔墻及吊頂較多地采用金屬板，對電磁波具有較強的屏蔽作用，對無線通訊的影響尤為巨大。一旦發生火災，消防人員救援時的無線通訊系統很難在潔凈區內使用，使消防救援行動更為困難。
濰坊凈化車間與無塵車間-潔凈廠房施工案例
五、火災蔓延迅速，早期發現困難
潔凈室一般均有較高的溫濕度要求，送風、排風和除塵風管較為復雜，風管通常布置在潔凈室上方的技術夾層內，發生火災時火勢易順著風道迅速蔓延。潔凈廠房內風管密布，大量使用難燃保溫材料。一旦發生火災，不僅會造成火災蔓延，更會大量產生有毒有害的燃燒產物，也容易引起人員的傷亡。潔凈室內工藝物料和公用工程管道、電纜布置錯綜復雜，且布置隱蔽，一般安裝在技術夾層或暗敷于隔墻內，發生故障不易及時發現，火災隱情不易發現。
六、生產工藝特殊，次生災害控制困難
部分潔凈廠房由于生產生物活性物質，一旦發生火災，不僅要控制、撲滅火災，還要控制次生災害的產生。一旦控制次生災害措施不當，造成環境污染的后果將遠遠大于火災造成的后果。
