主要特征編輯
(1)circRNA由特殊的可變剪切產生,大量存在于真核細胞的細胞質中,但少部分內含子來源的circRNA則存在于細胞核內,具有一定的組織、時序和疾病特異性;
(2)廣泛存在于人體細胞中,有時甚至超過它們線性異構體的10倍之多;
(3)與傳統的線型RNA(linear RNA,含5'和3'末端)不同,circRNA分子呈封閉環狀結構,不易被核酸外切酶RNaseR降解,比線性RNA更穩定;
(4)具有高度保守性,部分具有快速的進化性改變;
(5)大多數來源于外顯子,少部分由內含子直接環化形成;
(6)部分circRNA分子含miRNA應答元件(miRNAresponse element,MRE),可充當競爭性內源RNA(competing endogenousRNA,ceRNA),與miRNA結合,在細胞中起到miRNA海綿的作用,進而解除miRNA對其靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達水平;
(7)可以翻譯成蛋白質,但大部分是非編碼RNA。
形成機制編輯
circRNA通過非經典剪接方式進行反向剪接形成。一種模型認為pre-RNA 的轉錄過程中由于RNA發生了部分折疊,拉近了原本非相鄰的外顯子,從而發生了外顯子跳躍( exon skipping ) ,使得被跨越的區域形成了環形RNA中間體,進一步通過套索剪接形成由外顯子構成的環形RNA分子。另一種模型認為,位于內含子區域的反向互補序列導致了內含子區域配對介導反向剪接從而形成環形RNA分子。
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