醫院和醫療衛生機構排出的含大量病菌、病毒和其他有毒有害物質的生活廢水。按醫院性質可分為傳染病醫院廢水和綜合醫院廢水；按廢水成分可分為有放射性醫院廢水、廢棄藥物醫院廢水、含重金屬離子醫院廢水。
醫院污水的主要水質特征之一為來源及成分復雜，污水中含大量的病原微生物和化學藥劑，具有空間污染、急性傳染和潛伏性傳染的特征。 常規醫院污水處理設施在處理過程中，受到技術工藝的制約，主要是活性污泥微生物種類和數量少，系統內物理、化學、生物化學反應過程不*，并且，一些病原微生物易隨出水排放、擴散等，使得常規污水處理工藝對醫院污水中，對于主要有機、無機污染物，以及病原微生物的處理效率不高。
醫院污水受到糞便、傳染性細菌和病毒等病原性微生物污染，具有傳染性，可以誘發疾病或造成傷害。醫院污水中含有酸、堿、懸浮固體、BOD、COD和動植物油等有毒、有害物質。  牙科治療、洗印和化驗等過程產生污水含有重金屬、消毒劑、有機溶劑等，部分具有致癌、致畸或致突變性，危害人體健康并對環境有長遠影響。

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