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預測蛋白質功能位點方面取得重要進展

時間:2011-3-7閱讀:221
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隨著蛋白質結構信息的不斷積累,以及結構基因組學不斷的發展,越來越多的功能未知但結構已知的蛋白質提交到了大分子數據庫中,這些蛋白質的功能及其功能位點需要注釋.以前一些已知功能的蛋白質的功能及其功能位點可能需要重新注釋。因此,發展一種,快速的可用于大規模功能注釋的算法是結構生物信息學的重要研究內容之一。盡管已有許多算法用來對蛋白質結構或序列進行功能注釋,但這些算法的性,敏感度等需要更進一步的提高。

zui近,黃京飛課題組的李功華博士生在導師的指導下,開發出了一個新的預測蛋白質功能位點的算法(CMASA)。這個算法相對于其它已知的算法具有更高的性和敏感性,而且具有計算速度快的特點。利用CMASA,黃京飛課題組成員對PDB數據庫中的酶進行了催化位點的注釋并發現了166個新的未被注釋的酶的催化位點。

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